Øst-Timor, 1975. Indonesia er i ferd med å invadere landet og fem journalister fra australsk tv stasjonerer seg i den lille byen Balibo. Da journalistene plutselig forsvinner, reiser krigsreporteren Roger East til byen for å finne ut hva som egentlig har skjedd. Dette er opptakten til en hendelse som både den indonesiske og australske regjering forsøker å legge lokk på i mange år... Balibo er en urovekkende politisk thriller som skildrer den historiske "Balibo Five"-tragedien. En hendelse som har gitt opphav til utallige konspirasjonsteorier gjennom årene. Filmen ble forbudt i Indonesia, men førte også til at det ble satt i gang en offisiell utredning.